Faktura poza KSeF – czy podatnik straci prawo do odliczenia VAT?

Obowiązkowy KSeF od 2026 roku

Od 2026 r. każdy czynny podatnik VAT w Polsce będzie zobowiązany do korzystania z Krajowego Systemu e-Faktur (KSeF). Już teraz przedsiębiorcy pytają, co stanie się, gdy pojawi się faktura poza KSeF i czy w takiej sytuacji zachowają prawo do odliczenia VAT.

Praktyczne pytanie — co, jeśli faktura trafi poza system?

Wyobraźmy sobie sytuację, kiedy:

  • dostawca uważa, że nie ma obowiązku wystawiania faktur przez KSeF (np. przez brak stałego miejsca prowadzenia działalności w Polsce), a po czasie okazuje się, że jednak powinien,
  • lub tłumaczy się awarią systemu, choć KSeF działał poprawnie.

W takich przypadkach pojawia się pytanie: czy podatnik może odliczyć VAT z faktury, która została wystawiona poza systemem?


Interpretacja KIS – faktura poza KSeF nie odbiera prawa do odliczenia VAT

Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej w interpretacji z 4 marca 2025 r. (0114-KDIP1-3.4012.838.2024.1.MPA) potwierdził, że otrzymanie faktury poza KSeF nie powoduje utraty prawa do odliczenia VAT. Organ wyjaśnił, że prawo to przysługuje wówczas, gdy:

  1. podatnik jest czynnym podatnikiem VAT,
  2. zakupione towary lub usługi są wykorzystywane w działalności opodatkowanej.

Ponadto, przepisy (art. 88 ust. 3a ustawy o VAT) nie wymieniają przypadków, gdy faktura sporządzona poza KSeF — mimo że powinna być w systemie — uniemożliwia odliczenie.


Faktura poza KSeF a art. 88 ustawy o VAT

Przepis art. 88 ust. 3a ustawy o VAT przewiduje wyjątki, gdy faktura nie daje prawa do odliczenia m.in.:

  • dokument wystawiono przez podmiot nieistniejący,
  • nieodpowiadający rzeczywistości,
  • dokumentuje fikcyjną transakcję,
  • dotyczy transakcji zwolnionej z VAT.

Żaden z tych przypadków nie dotyczy faktur wystawionych poza KSeF, choć formalnie poprawnych, więc prawo do odliczenia VAT dalej przysługuje.


Czy faktura poza KSeF odbiera prawo do odliczenia VAT?

  • Prawo do odliczenia VAT pozostaje nienaruszone, nawet gdy dokument trafił poza system — o ile transakcja jest rzeczywista.
  • Odpowiedzialność za brak przesłania faktury do KSeF spoczywa na dostawcy, nie na nabywcy.
  • Dobry moment — wdrożenie procedur, które przygotują firmę na potencjalne błędy i przypadkowe pominięcia.

Praktyczne ryzyka i co warto robić

Mimo ochrony, warto być czujnym:

  • Konieczność udowodnienia autentyczności dokumentu podczas kontroli.
  • Audyt wewnętrzny faktur: lepiej wcześniej niż później.
  • Wymiana dokumentów z dostawcami — monitorowanie zgodności z KSeF.

Wskazówka: stwórz procedury awaryjne dla faktur poza systemem oraz odpowiednie zapisy w umowach z dostawcami i biurem rachunkowym.


KSeF – jak przygotować firmę?

  1. Przeprowadź audyt procesów i systemów finansowo-księgowych.
  2. Przeszkol zespół — w tym szczególnie dział księgowości i dział zakupów.
  3. Dostosuj systemy IT — by obsługiwały KSeF (XML, integracja).
  4. Przygotuj procedury awaryjne — np. dla faktur poza systemem.
  5. Zadbaj o konsultacje z doradcą podatkowym, by aktualizować wiedzę na bieżąco.

Podsumowanie

Choć KSeF wprowadza obowiązek nowego standardu fakturowania, faktura wystawiona poza systemem nie pozbawi podatnika prawa do odliczenia VAT, jeśli dokument jest prawdziwy i spełnia warunki formalne. To daje sporo elastyczności, zwłaszcza na początku wdrożenia. Warto jednak odpowiednio przygotować firmę i procesy, aby uniknąć chaosu i niepotrzebnych sporów z fiskusem.

👉 Potrzebujesz wsparcia w przygotowaniach do KSeF i wdrożeniu procedur? Skontaktuj się z Audyt Legis — pomożemy Ci przejść przez zmianę bezpiecznie i pewnie.


Czytaj również: KSeF – praktyczny przewodnik dla przedsiębiorców i biur rachunkowych KSeF – praktyczny przewodnik dla przedsiębiorców i biur rachunkowych

Faktura poza KSeF – odliczenie VAT po 2026 roku według interpretacji KIS